Из эвакуировавшихся в глубокий тыл эстонских граждан и отошедших с боями солдат в 1942 году сформировался национальный Эстонский стрелковый полк, который в боях завоевал почетное звание гвардейского. Позже полк был преобразован в корпус. Эстонский корпус участвовал в освобождении от оккупантов многих русских и эстонских городов и первым вошел в Таллин.

Около 20 тысяч эстонских воинов были награждены орденами и медалями Советского Союза. Звание Героя Советского Союза получил Арнольд Мери - заместитель министра просвещения Эстонской ССР. Посмертно высокое звание было присвоено бесстрашной разведчице Леэи Куллман и другим героям.

Осенью 1944 года немецко-фашистские войска были изгнаны за пределы Эстонии.